Шифрирање је процес кодирања ваших података на такав начин да их могу прочитати само они који су овлаштени. То се постиже тако што се читави подаци кодирају у облик сличан коду који се може декодирати само кључем за дешифровање. Ово омогућава кориснику да заштити своје податке и своје податке чак и у случају губитка или крађе уређаја. Погледајмо неке од најпопуларнијих техника шифровања које су тренутно доступне у Линуксу.
Доступна су различита решења за имплементацију различитих врста техника шифровања. Алати попут ТруеЦрипт и ВераЦрипт користе се за шифровање чврстих дискова и партиција, али нису ефикасни за опште шифровање датотека или докумената. ГПГ је бесплатан и једноставан за коришћење алат који се може користити за шифровање тајних датотека сигурном асиметричном енкрипцијом која се не може лако наметнути грубо.